若巧克力囊肿4cm，算是比较严重的情况，在临床上有手术指征。因为随着囊肿增大，局部压力通常会增高。一旦巧克力囊肿出现破裂，就会造成严重的后果。囊肿中有子宫内膜碎片、血液，一旦破裂就可能会造成盆腔感染，会导致子宫内膜碎片在盆腔内、腹腔内的任何一个器官种植，进而造成严重后果。

因此，建议巧克力囊肿4cm的病人可以考虑手术治疗。临床上可选择开腹手术，也可选择腹腔镜手术，上述手术方式都会取得比较好的效果。但要注意，并不是做完手术就结束治疗了，还要经过后续治疗，比如服用唯散宁(地诺孕素片)抑制子宫内膜生长，减少巧克力囊肿复发的可能性。

此外，也建议病人做完手术后定期到医院复查，虽然有的病人经过后续治疗，但仍有复发的可能性。所以建议病人分别在术后3个月、0.5年、1年到医院进行相应检查。还需要注意，若巧克力囊肿的病人做完手术之后想怀孕，建议尽快怀孕。