吃磷霉素氨丁三醇散，大约需要29个小时，即一天多的时间，就可将药物排出体外，之后才可考虑怀孕。磷霉素氨丁三醇散在水中完全溶解，口服后胃肠道可迅速吸收，主要通过肾脏排出体外。如果口服1次磷霉素氨丁三醇散，大约50%的药量从人体内排出需5.7个小时，因此5倍时间，即29小时后，大约有97%的药量会从体内排走，通常认为此时后剩余药物对怀孕的影响较小。
但如果肾功能减低，即肌酐清除率经过专业计算后，表明有肾功能异常，药物排出体外的时间会有所延长。另外，用餐也会影响本品吸收，也可能会引起排泄时间有所改变。因此如果正在计划怀孕，在服药时应咨询医生，根据自身情况，在医生专业指导下进行相应用药方案调整。
