面肌痉挛的诊断主要靠临床表现，容易与以下几种疾病混淆：

1、梅杰综合征：又称眼睑、口、下颌肌张力障碍，属于椎体外系疾病，即成人多动症，发病年龄40-60岁，分为三种类型，第一类是眼睑痉挛型，单纯双侧眼睑抽搐，与面肌痉挛容易混淆；第二类是眼睑痉挛合并口、下颌肌张力障碍，眼睑和口部均有抽搐；第三类是口下颌肌张力障碍型，表现为单纯下颌部抽搐。梅杰综合征70%-80%的表现为双侧眼睑痉挛，部分单眼起病，最终发展成为双眼，表现为眼睑痉挛、口角收缩、打哈欠、不自主张口、撅嘴、磨牙等，属于异常运动。不随意运动没有规律性，目前尚无确诊本病的特异性检验方法，主要依靠临床表现；

2、面瘫后遗症：面神经炎后周围神经面瘫，发生神经再生，兴奋性不同造成眨眼，具有异常连带动作或者轻微面肌抽搐，仔细询问面瘫病史、电生理检查可以鉴别诊断；

3、癫痫：癫痫小发作可以表现为一侧面部抽搐，抽搐幅度比较大，脑电图见癫痫样放电，可以明确诊断。部分患者头部核磁可见脑内病变；

4、全身不随意运动：如舞蹈症、手足徐动，可以表现出面部症状。