阻塞性黄疸需明确病因后采取相应的治疗手段，结石性阻塞性黄疸可以常规取石治疗，但阻塞性黄疸最常见原因是良恶性肿瘤，分类非常多，如部分良性肿瘤里需要手术治疗，部分自身免疫性疾病需药物治疗。如果黄疸很高，也要通过外科手段甚至内镜手段先进行减黄治疗。

如果是恶性肿瘤导致阻塞性黄疸，建议做根治性手术，包括胆管癌、胰头癌或十二指肠壶腹恶性肿瘤，均可通过手术方式治疗。如果无法耐受手术，也可以通过外引流减轻黄疸，因严重阻塞性黄疸对病人肝脏损害非常大，一旦出现肝脏功能衰竭，可能生存时间上会影响非常大。