肛瘘是肛门直肠瘘简称，其为在肛门直肠周围的脓肿溃破或切口引流后的病变。一般有内口和外口，中间以管道相连。肛瘘一旦发生，只能通过手术治疗。手术治疗主要是切开引流，把瘘管破坏切除，同时也可以根据情况切除内口及外口，将伤口完全敞开，达到比较好的治疗效果。但如果肛瘘处于发作期，合并感染时，身体比较弱，不能进行手术治疗，也可以在感染灶表面做小切口，将脓液引出，从而缓解症状，控制病情进一步发展，这种手术效果立竿见影，但是为暂时缓解，日后待感染完全控制后还要进行根治性手术治疗。

如果肛瘘位置较高，影响括约肌，因括约肌在排便过程中发挥非常重要的作用，故手术不可以影响排便功能，所以可以采用置管或挂线引流，既解决肛瘘问题，又避免损伤括约肌。对肛瘘可以做切开，在临床过程中非常常见，90%以上低位肛瘘通过这种方法可以得到有效治疗。另外还有一些方法，如填塞栓塞等。手术方法很多，但基本原则相同，需将肛瘘内口、外口和中间瘘管进行有效手术切除，达到较好的临床效果，则可治愈。对于较重的复杂肛瘘，如肛瘘有多个外口，多个内口，不是一个瘘管，处理相对较棘手，可能需多次手术治疗，才能达到较好的治疗效果。