服用二甲双胍常见的不良反应是腹泻，因为二甲双胍是双胍类的降糖药，会减少肝脏葡萄糖和肠道葡萄糖的摄取。所以肠道里葡萄糖的含量会增高，结肠等部位的渗透压相对偏高，这时可能会出现水分吸收减少、增加肠道粪便的水分，这样大便会偏稀，容易出现腹泻的状况。二甲双胍还可以导致腹痛、恶心、呕吐等情况，在临床上要注意。如果腹泻不严重，不必换药，如果腹泻严重影响生活，要换药。
二甲双胍通常是一线的降糖药物，大部分2型糖尿病患者确诊后的首选药物是二甲双胍，尤其是对肥胖体型的糖尿病患者而言有降糖、降体重的作用。另外，二甲双胍有可能导致乳酸酸中毒，所以对肝功能有损害、肾功能有损害、慢性酒精中毒的患者要慎用，必要时可以选择其他的药物或者是胰岛素进行治疗。
