鱼肝油不可以代替维生素D3，因为二者的成分不一样，所以起到的作用也不完全相同。鱼肝油中含有D3，同时还含有维生素A，所以是两种成分的药物。鱼肝油主要预防和治疗维生素A和维生素D缺乏症，如佝偻病、夜盲症、小儿手足搐搦症等。
维生素D3的成分比较单一，同时鱼肝油是天然产物，从鱼类的肝脏中提取出来的脂肪性成分，而维生素D3是人工合成，但维生素D3和鱼肝油起到的药理作用基本类似，其中维生素D3可以促进钙的吸收，维生素A促进人体生长和发育所必需的物质，所以鱼肝油以及维生素A、维生素D类的制剂，对于婴幼儿的发育，还有上皮组织的完整性以及视力、血钙、血磷等，以及对于骨骼和牙齿的生长都有非常重要的作用。此两种药物成分虽然主要都是维生素补充剂，但需要必须按照推荐剂量服用，如果超量服用，可能引发不良反应。
