胃窦黏膜慢性炎症在病理报告上比较常见，通常指在病理切片上，观察到局部有黏膜中度慢性炎、急性和慢性炎症，或淋巴细胞聚集。胃窦炎症还要关注是否有肠上皮化生、不典型增生等情况，上述情况在病理上均可以分为轻度、中度、重度，若出现重度肠化或不典型增生，多半提示有胃癌前病变。一旦出现这种情况，要求患者最近3个月再复查胃镜。若出现比较可疑的，如重度不典型增生的镜下表现，还需精查胃镜进一步明确。
胃镜病理中明确黏膜慢性炎有轻度到中度的肠化或不典型增生，便认为患者发生萎缩性胃炎。轻度的萎缩性胃炎可以用药物治疗，疗程通常为3个月，重度萎缩性胃炎疗程为3-6个月，通常要求患者在治疗1年后再复查胃镜，根据胃镜病理情况，进一步指导治疗。
