患者扁桃体发炎全身酸痛无力，通常会引起高烧，如39-40℃，并且咽喉剧痛，伴有吞咽疼痛明显。此时要给予抗生素，例如头孢类、阿奇霉素类、喹诺酮类药物口服，甚至静脉给药。若高烧严重需口服退烧药，局部要给予激素类药物雾化吸入或含片、漱口水，以及治疗咽喉炎的中成药治疗。综合治疗后扁桃体炎症得到控制，全身酸痛无力，以及发烧、咽痛的情况会逐渐痊愈。
但少数患者因治疗不及时或用药效果不佳，导致治疗5天后高烧不退，且逐渐出现张口困难、说话含糊、吞咽障碍等症状。这时要去医院就诊，可能患有扁桃体炎的并发症，例如扁桃体周围炎或扁桃体周围脓肿，检查可看到一侧扁桃体被推向中线或对侧。此时要将脓肿切开引流，持续用药治疗，2周左右症状能够完全消除。
