服用盐酸达泊西汀存在相应副作用，如说明书中提到临床试验中发生的一系列不良反应症状，包括晕厥伴意识丧失。大部分晕厥病例，通常在首次给药后3小时内发生，而且往往在医疗操作过程中，如对患者进行抽血、直立状态下、测量血压过程中，发生晕厥的不良反应，在临床试验中还发现存在直立性低血压等不良反应报告。
此外，不良反应包括头痛、眩晕、恶心、腹泻、失眠和疲劳等，常见概率约5%，发生概率相对较高。较严重时可能导致停药不良反应出现，包括恶心、眩晕等。其他不良反应症状，包括视力模糊、焦虑、嗜睡、耳鸣、腹胀、皮肤潮红等症状。因此，需要在使用过程中，关注不良反应症状，而且需注意服药时避免饮酒。
