卵巢囊肿引起月经发黑又少，此时应该进一步检查内分泌六项、甲状腺功能，以及肿瘤标记物，来决定是否需要补充雌孕激素及是否需要手术治疗。多数情况下，卵巢囊肿不会引起月经改变，部分卵巢囊肿，尤其是卵巢巧克力囊肿，在手术后可能会对卵巢功能造成一定影响，引起卵巢功能减退，月经就会发黑、变少。

对于有性生活的女性，如果初次出现这种异常出血，需要排除妊娠的可能，可以进行HCG检查。如果HCG阳性，而B超提示卵巢部位有占位，还要高度警惕宫外孕的可能。如果HCG是阴性，B超可以帮助判断月经的异常，是否有宫腔粘连、子宫内膜息肉、子宫内膜异位症、卵巢巧克力囊肿等情况。如果有相应的情况，可以考虑进行手术宫腔粘连分离术、子宫内膜去除术，或者是手术切除卵巢巧克力囊肿。

根据内分泌检查的结果，如果卵巢功能下降，雌孕激素减少，可以给予补充雌孕激素，如戊酸雌二醇加地屈孕酮。如果是甲状腺功能减退，需要补充甲状腺功能。此外，还应该注意避免着凉，避免服用辛辣刺激的食物，调整心情，防止精神压力过大、情绪欠佳引起的月经量少、变黑。而对于卵巢囊肿，则可以进行肿瘤标记物检测，根据囊肿大小及检查结果来决定是否需要手术。如果肿物瘤超过5cm，或者其内有分隔、血流、结节、肿瘤标记物升高，需要手术治疗，术后再进一步调整月经。如果囊肿很小，肿瘤标记物正常，可能是生理性囊肿，在月经规律以后可能会自然消失。