女性来月经时，不建议注射宫颈癌疫苗。无论是二价宫颈癌疫苗，还是四价、九价宫颈癌疫苗(HPV疫苗)，都不建议注射，应等到月经后再进行注射。因为月经期是女性的特殊生理时期，经期抵抗力和免疫力下降，易出现身体不适症状，如头痛、乏力、腰酸、腹部坠胀不适，如果有经期综合征，上述症状会更加明显。而此时注射HPV疫苗会导致身体更加虚弱，所以经期不建议注射宫颈癌疫苗。
HPV疫苗注射后，刺激免疫反应，对HPV相应分型产生抗体，才能起到预防感染HPV的作用。HPV疫苗本身不影响内分泌，所以不影响月经。如果在宫颈癌疫苗接种后出现月经异常，主要考虑是内分泌、子宫病变等妇科疾病引起月经紊乱。但疫苗注射可能会产生不良反应，如恶心、胃痛、头痛、乏力、腰酸、过敏等，易和经期综合征混淆，也可能加重经期症状，所以建议女性月经期不要注射宫颈癌疫苗。
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