激光去除胎记的副作用是激光的能量如果过大会损伤到胎记的相应位置，可能会在皮肤上留下部分凹凸不平的痕迹，即留下疤痕。激光在治疗后，若没有进行良好的皮肤护理而出现感染的情况，也容易导致创面加深而出现凹凸不平的疤痕。
还有是不注意防晒，没做好基础的修复和补水，可能会使局部出现色素沉着。本来患者是咖啡色或红色的胎记去除后，可能会相应的位置留下暗沉的皮肤颜色变化，在胎记治疗后，也容易发生。
所以对于胎记的激光治疗，其实是医生要用通过自己的医术来进行胎记去除。在去除后，患者应该遵照医生的建议，给予相应位置的护理，从而保证相应位置保持良好的愈合状态。
还要注意基础的皮肤护理，即补水、保湿和防晒，待皮肤状态恢复稳定后。再恢复日常的工作和生活，对于胎记治疗后的稳定状态以及治疗效果的维持比较有用。
