肚脐不舒服，常见以下几种原因：
1、肚脐本身病变：如肚脐本身出现炎症，积的污垢较多，可能洗澡时，没有注意清理肚脐的污垢，也可能长时间不洗澡，此时会引起局部的刺激，引起不舒服，甚至部分患者肚脐可能出现炎症，应将肚脐眼里的污垢，清理干净；
2、肚脐本身疾病：肚脐本身可能伴有肚脐疝，即肚脐部出现鼓出的小包，可能是肚脐的憩室、肚脐疝。腹腔里器官的恶性肿瘤，癌细胞也可以转移到肚脐，可能会长出新生物、流水等，此时应及时去医院进行检查，根据不同的疾病，做相应的治疗；
3、肚脐里肠管的疾病：常见小肠疾病，如出现肠功能不舒服、肠功能紊乱，造成肠胀气或肠痉挛性收缩，也会引起肚脐的疼痛、不舒服，此时应针对胃肠道功能紊乱，进行纠正。
