由于智齿是最后一颗萌出的恒牙，随着人类的进化，智齿往往在萌出时没有足够的空间和位置，造成智齿可能发生阻生、位置和方向异常。而发生阻生和位置、方向异常的智齿，可能会顶坏前面的好牙齿，尤其是顶坏前面的第二磨牙，导致第二磨牙的远中龋坏，引发第二磨牙牙髓炎、根尖周炎等。
在智齿部分萌出阻生的情况下，还可能引起智齿冠周炎的反复发作。智齿牙冠和牙冠表面，形成盲袋，导致食物嵌塞、细菌滞留，可能形成智齿冠周炎的反复发作，导致局部牙龈肿胀、口水咽痛等。而智齿冠周炎的反复发作，可能对健康造成危害。
另外智齿如果处于埋伏阻生状态，还可能形成含牙囊肿，甚至可能进一步发展而破坏上颌骨和下颌骨等。因此在多数情况下，建议拔掉智齿，以预防上述病变的产生。
当然在某些情况下，如果智齿位置和方向完全正常，能够完全萌出，并正常行使咬合功能，智齿也可以保留。因此在长智齿时，务必到医院进行仔细检查，再决定是否需要拔除以及何时拔除。
