如果是急性化脓性扁桃体炎，一般需要适当的抗生素治疗，如青霉素类的药物，一般使用3天的时候症状就会明显缓解，一般整个疗程需要10天才能达到有效治愈，并且有效预防复发。
当使用抗生素治疗3天的时候，如果症状持续加重，如咽痛仍然持续加重、发烧仍然持续不退，这个情况就要考虑药物可能效果不好。必要时需要调换其它药物，如更高级别的抗生素以达到更好的效果，以更快的控制病情。
慢性扁桃体炎通常病程是一个长期过程，患者可以感觉到咽喉的异物感、堵塞感、烧灼感等不舒服感觉，但是没有明显的咽痛和发烧。这个情况就要针对病因进行治疗，才能慢慢恢复。
如有的患者和胃酸胃液反流刺激有关系，也就是反流性咽喉炎的症状，这就需要用抑制胃酸的药治疗，才能慢慢取得好的疗效。
