脑血管介入手术的后遗症，更准确地可以称为脑血管介入手术的危险并发症。轻微的并发症，包括急性脑梗、脑出血，及相应血管区域夹层、小血管分支堵塞及导管内血栓脱落、气栓发生。严重时会导致大面积脑梗、脑出血的发生，与手术医生、患者血管解剖结构有直接关系。

主要后遗症为缺血，即脑梗，继发于血管介入手术，会出现的急性脑血管闭塞。如果是小血管堵塞，则患者症状相对较轻，通常经过一段时间的治疗后，可有临床痊愈的可能。如果患者堵塞部位较大，则后期可能会出现后遗症，包括言语障碍、吞咽功能障碍、肢体偏瘫。更严重时，可能会出现不同程度的意识障碍，甚至危及生命。