幽门螺杆菌阳性能够治愈，如果通过碳13呼气试验或碳14呼气试验检查结果为阳性，表明体内存在有幽门螺杆菌，可以通过四联疗法进行治疗。四联疗法为两种抗生素、铋剂、质子泵抑制剂联合使用，抗生素首选阿莫西林，对于幽门螺杆菌较为有效。如果患者青霉素过敏，不能选用阿莫西林，建议用四环素代替。而另一种抗生素可以在克拉霉素、甲硝唑、呋喃唑酮、喹诺酮类药物中进行选择。
除此之外，如果抽血检查发现抗体阳性，只是表示既往有过感染，往往并不一定表明目前体内存在幽门螺杆菌。如果既往感染过幽门螺杆菌，抗体会在体内存在很长时间，此时有可能不需要特殊治疗。
