碘缺乏危害最严重的人群，是胎儿和新生儿。
碘是甲状腺生产甲状腺激素的原料，碘缺乏以后，甲状腺生产甲状腺激素就会减少，此时脑垂体就通过分泌促甲状腺激素来帮助甲状腺，让甲状腺肿大，让甲状腺代偿性地分泌甲状腺激素增多。
碘缺乏对人体可能有各种损害，包括甲状腺肿。但是碘缺乏对人类最大的危害是影响大脑发育，即使是轻度到中度的碘缺乏，也有可能造成脑发育的障碍。
有研究发现，碘缺乏以后有可能造成死胎、流产，甚至出现先天性畸形，还有可能造成新生儿甲减，严重影响后代的智力，可以影响下一代的人口素质。
由于碘缺乏以后，可造成一系列的代谢损伤，通过明确病因、采用全民食盐加碘，能够有效地预防和根除碘缺乏疾病。食盐加碘以后，在治疗期间要注意评估使用盐的量及盐的质量，要测定甲状腺功能状态，有助于了解预防的效果。
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