通常顽固性、药物难治性的癫痫患者，术后仍然需要维持药物治疗三年左右，可以考虑逐步停药。如果患者癫痫得到控制，可以完全康复。癫痫是大脑皮层的同步化放电，大多都有最先起源之处，起源之处就是手术的目标，如果能寻找到起源进行处理，癫痫可以得到根治性治疗。另外可能很难寻找到病灶，或者病灶即使找到，可能处在非常重要的位置，无法切除。在这种情况下，可以考虑做姑息性的方法，比如严重发作的患者可以做胼胝切开，能减缓发作的次数和程度。
还可以针对难以控制的癫痫，埋入电刺激器做神经调控，这也是很好控制癫痫的方式。对于根治性的癫痫手术的治疗，把病灶切除之后，发作会大幅的得到控制。但是大多患者都是常年发症的患者，周围脑组织易感性较高，所以仍然是需要服药一段时间来减少易感性，获得很好的治疗。
