肉毒素在临床上用于治疗鱼尾纹、额纹、眉间纹，也可以注射咬肌，即俗称的瘦脸。治疗鱼尾纹、额纹、眉间纹一般起效时间是3-7天，如果是咬肌，可能见效的时间比较长，一般在1-2周可以慢慢见到效果。
另外，肉毒素在临床上还用于治疗多汗症，尤其是腋下多汗症，往往需要半个月到一个月以后才能逐步看到效果，在一个半月左右可能会达到最佳效果。
肉毒素还可用来治疗手足多汗症，手足多汗可能影响工作，甚至按不上指纹，这种情况可能起效更慢，一个月、一个半月或两个月以后才能逐步看到效果。所以肉毒素注射治疗的部位不同，起效时间和持续时间都会有所不同。
