新生儿甲减部分可自然缓解，但部分只能靠药物干预，主要取决于发生原因，具体如下：

1、若新生儿甲减是因甲状腺缺如、异位，或甲状腺素合成缺陷导致，则考虑为永久性甲状腺功能减低，就目前医学水平而言，此部分患儿需要终身服用甲状腺素，如优甲乐；

2、部分患儿是因在母体时，妈妈有甲状腺疾病，对其甲状腺发育造成暂时性影响，或者因早产或其它原因导致甲状腺功能不成熟，在外界替代补充或其他因素解除后，此部分孩子甲状腺功能可以恢复，甚至最后无需药物治疗可达到自然缓解状态，但此过程不能叫治愈。对于因早产、甲状腺未发育成熟，或者母亲有甲状腺疾病出现的甲减，待患儿2-3岁可尝试停药，若甲状腺功能恢复正常，则此后无需药物治疗。