灰指甲在早期通过药物治疗是完全可以根治的疾病，这一类药物叫抗真菌药物，如酮康唑、萘替芬酮康唑、达克宁以及最新抗真菌药物，都可以很好的预防和控制该类灰指甲的进展，通过治疗大部分都可以得到很好的治愈。

但对于晚期指甲破坏严重、指甲变形，药物治疗作用就受限制。因为该类指甲增厚使得药物很难渗透进皮肤，需要外科处理，包括拔甲、甲床修整，还可让该类灰指甲得到治愈。需要注意防止交叉感染，家庭要做到各自使用各自的拖鞋，同时若家庭里都有真菌感染灰指甲，要一起使用该类药物，才能够最终杜绝灰指甲复发。