ICL手术是内眼手术，只要是手术都会存在风险，例如角膜屈光手术，在角膜上进行，手术植入到眼内去，像照相机一样，动到照相机内部。因为ICL手术也做了很多年，而且最新的晶体是中央带孔型，所以像过去提到的白内障、青光眼的风险现在越来越低。但是只要是进行手术，还是需要进行很好的保护，避免接触到眼睛。如果是进行带散光的ICL手术，患者还要避免过度揉眼睛，以避免晶体偏位。
因为做ICL患者很多都是存在高度近视或超高度近视，因此会非常容易出现眼内疾病，如视网膜变性、黄斑问题，所以需要做完手术以后定期到医院复查，以避免眼内疾病风险。
