乙肝患者自愈的标准，是乙肝五项由原来的大三阳出现e抗原转阴、e抗体转阳、表面抗原转阴，同时会有表面抗体出现，表现为表面抗原转阴的同时表面抗体转阳。且用高灵敏的办法检测不到乙肝病毒基因(HBV-DNA)，说明病毒含量在最低的检测值以下。而且肝功能正常、肝脏影像学指标检查正常，即肝脏超声、CT、核磁检查正常，出现上述情况说明乙肝发生自愈。对于此类患者，乙肝五项通常表现为表面抗体、核心抗体阳性，或表面抗体、核心抗体、E抗体阳性。
但对于此类患者，仍有14%的人群在肝细胞核内有乙肝病毒cccDNA的存在。如果一旦有免疫力下降，如大量、长期饮酒，或过度、长期劳累，亦或是长期应用免疫抑制剂，微量cccDNA病毒基因成分会被再激活，病毒会再活跃复制，对肝脏造成损伤，且此类患者仍有发生与乙肝相关肝癌的较小几率。因此对于已经发生乙肝自愈的人群，在免疫功能正常的情况下，一般对人体没有任何影响，但一旦有免疫功能低下的因素出现，要定期复查乙肝五项和肝功能，判断是否有乙肝病毒再激活。
