飞秒激光近视手术虽然比较先进，比较安全可靠，预测性也比原来准分子激光有比较大的提升，但是这种手术还是有一定的并发症或者后遗症，比较常见的有以下几点：

1、感染：虽然发生率比较低，但是只要是手术就可能有感染；

2、角膜状态改变：因为飞秒激光手术是在角膜基质层内做透镜，切削角膜的基质部分，基质部分可能存在纤维重排，所以有些比较敏感的患者术后可能会发生角膜比较薄的云翳、斑翳的现象，这种现象可以在使用糖皮质激素眼药之后数月到半年的时间内慢慢消退；

3、干眼：因为角膜基质有比较多的神经纤维末梢，如果手术做透镜切断，这些神经纤维的末梢可能会影响泪液分泌，造成术后干眼；

4、屈光回退：有些原本是高度近视的患者做完手术之后，患者觉得一劳永逸就放松警惕心，没有注意保护眼睛，又造成屈光回退、眼轴再次增长，角膜曲率可能也发生变化，所以术后又发生比较低度数的近视，这种情况也有很多。