3个月的孩子总咳嗽，建议查明咳嗽的原因，咳嗽只是一个症状，孩子咳嗽通常说明出现呼吸道感染，可能是上呼吸道感染。

由于孩子免疫力不成熟，其体液免疫功能和细胞免疫功能比较低下，如果反复咳嗽，容易出现下呼吸道感染，即气管炎、支气管炎等情况。因此咳嗽迁延不愈，建议前往医院检查血常规，以及支原体、衣原体抗原，明确咳嗽原因，采取对应治疗。具体如下：

1、病毒感染：如果为病毒感染造成的咳嗽，可以服用抗病毒药物；

2、细菌感染：如果为细菌感染造成的咳嗽，应在医生的指导下，合理服用抗生素药物进行治疗；

3、支原体：如果是支原体造成的咳嗽，可服用大环内酯类抗生素进行治疗。

另外，孩子咳嗽时，应对症止咳，服用止咳化痰药物，但应在医生的指导下，合理应用药物，由于3个月的孩子较小，家长避免盲目给孩子服用药物，以免出现严重副作用，耽误病情。