目前子宫内膜增生症的发病率越来越高，其治疗包括药物治疗、手术治疗。药物治疗主要是孕激素，如黄体酮、地屈孕酮或者左炔诺孕酮，或者是含有左炔诺孕酮宫内节育系统的应用。如果口服药物，分为周期性用药或连续用药。目前更推荐连续用药，也就是持续的用药物3-6个周期，然后进行评估，进行子宫内膜的组织学检查。
如果伴有非典型性的子宫内膜增生，尤其合并肥胖、稀发排卵、无排卵、多囊卵巢，或者有乳腺癌的高危因素，或者是乳腺癌应用他莫昔芬等促进子宫内膜增生的药物。这种情况，其癌变的风险提高，而且合并子宫内膜癌的风险也非常高，需要手术治疗，即子宫切除术。同时卵巢是否保留，要根据病人的年龄来个体化决定。
同时子宫内膜增生，还有一部分人不伴非典型性，也没有异常子宫出血和其他的高危因素。此部分病人癌变风险非常低，而且有一部分自然消退的机会，所以此部分病人建议可以随访观察，然后定期评估彩超，或者进行宫腔镜的子宫内膜的组织学检查。如果没有进展，也可以不用药物治疗。
