奥美拉唑可以缓解胃部疼痛，但不是所有的胃病吃奥美拉唑都能缓解胃部疼痛，需要根据疾病判断。一般如果胃镜下发现胃糜烂、浅表溃疡、胃溃疡、十二指肠球部溃疡，存在这些溃疡性疾病，通常是使用奥美拉唑的适应症。可以通过口服奥美拉唑，升高胃腔的pH值，降低胃内胃酸浓度，减少高胃酸对已经形成糜烂和溃疡面的刺激，并且可以使胃内胃蛋白酶的活性降低。在pH值升高和胃蛋白酶活性降低的双重作用下，一般能够保证已经受损的部分糜烂和溃疡尽快愈合，达到促进黏膜愈合、缓解胃痛目的。
部分萎缩性胃炎患者，胃镜下没有发现溃疡、糜烂，这种情况口服奥美拉唑，通常无法缓解患者疼痛。通常这类患者出现腹痛，是由于萎缩性胃炎造成胃的排空障碍，可以使用修复胃黏膜的药物和促进肠道动力的药物，还可以使用部分消化酶类药物，改善胃的排空，进而缓解患者腹痛的症状。
