激光祛斑一般没有后遗症，因为激光祛斑有选择性，色斑是黑色素细胞及其合成的黑色素在局部的聚集，黑色素是深颜色，而皮肤的其他组织或细胞没有颜色，比如皮脂腺、汗腺等，深颜色会吸收较多的光，产生热和破坏作用，达到治疗的目的，没有颜色的或浅色的物质，没有很多的光热作用，是安全的，因此激光祛斑是选择性破坏，安全有效，一般不会遗留后遗症。
有些人体质比较特殊，治疗之后可能在1个月左右产生色素沉着，产生反黑的情况，一般需要3个月的时间慢慢会好，可以通过弱激光的刺激或者外用药物，促进色素沉着减退。除了色沉之外，还有少部分人会色脱，比周围正常的肤色浅，这种情况如果出现，一般1-2个月内会缓解，如果1-2个月没有缓解，色脱有可能终身存在。
采用不恰当的治疗参数、不合格的治疗设备，也有可能会造成永久不可恢复的损害，比如瘢痕，因此激光祛斑一般安全有效，也有可能会遗留永久性的损害，一定要到正规的机构进行治疗。
