并非所有的梅毒抗体均可转阴，若为梅毒的特异性抗体，如TPPA、FTA-ABS，无论如何治疗均无法转阴。以目前的手段，无法消除特异性抗体的阳性试验结果，而且也没有科学家研究如何消除此类阳性。因为阳性仅为人体对病原体的反应，对健康无害，更不是治疗所关注的指标。
部分单位对特异性抗体中的IgM抗体进行检查，该抗体可在治疗后转阴。如果转阴后又变成阳性，需怀疑复发或者再感染的情况。另外，RPR和TRUST类抗体属于非特性抗体，其目的是用于监测治疗效果，治疗的目标则是尽量使此类抗体转阴。
目前治疗梅毒的方法较为成熟，患者需遵循医嘱按时用药、定期复查，以及进行实验室检查。通常2-3年的治疗后复查，用于监测治疗的指标和IgM抗体多数可变为阴性，此时即可以判断梅毒已经被治愈。
