所谓靶器官，不是指机体某一个器官称为靶器官，而是指某一种疾病或者是某一种药物，主要作用于某个器官，这个器官就称为靶器官，比如病毒性肝炎，靶器官就是肝脏，因为肝炎病毒所导致的机体的损伤，主要是肝脏受到损伤，肝脏就是病毒性肝炎的靶器官。
另外，再比如高血压病，主要靶器官就是心脏、肾脏还有脑组织，因为高血压的情况下，受累的器官主要是心脏、肾脏和脑组织。
有些药物也针对某一个器官，比如用于治疗甲亢的碘-131，靶器官主要就是机体的甲状腺，所以药物针对某一个器官，就把这个器官也称为靶器官。像现在用于治疗肿瘤的一些靶向药物，不叫做靶器官，是靶细胞，主要是针对肿瘤细胞的这个细胞就叫靶细胞，不称为靶器官。
