HPV疫苗在注射结束之后，其实绝大多数并不会有什么非常明显的不良反应。当然也有一些女性，可能会在注射了之后，局部的皮肤有了红肿、硬结，有的时候可能会有轻微的压痛。大多数这种局部的反应很快的随着时间的延长，都能够自然缓解。
还有一部分女性，在注射了HPV疫苗之后，可能会出现全身的症状。比方说，有可能会突发性的发热、高烧，有的时候可能会出现全身的皮疹，有的时候可能会出现全身肌肉的酸痛，好像是流感一样，这种肌肉的酸痛很有可能会持续一定的时间。甚至还有极个别的女性，在注射了HPV疫苗之后，短时间之内就会出现高热，伴有寒战等。
当然，这样的不良反应，其实在临床上来讲极为少见，而针对于目前在各家医院能够注射到的HPV的疫苗，包括葛兰素史克的HPV的二价疫苗，包括默克公司的HPV四价和九价疫苗，也包括我国国内生产的二价疫苗。其实绝大多数在应用起来，安全性还是值得肯定，并不会有非常多的女性，因为注射疫苗而发生非常严重的不良反应。
所以考虑到HPV疫苗在接种了之后，能够得到更多的益处。这一点点的少许的不良反应，其实在绝大多数的女性，都可以忽略不计。
