甲状腺结节鉴别诊断，即分辨良性还是恶性，通常从甲状腺结节良恶性鉴别诊断来说，主要依靠辅助检查，最常用到的是B超。普通二维B超，对于甲状腺结节的形状、边界、血液供应、硬度，还有周围组织侵犯的情况会有相对比较好的反应。一般普通B超就可以做甲状腺结节的良恶性区别，有专门的良恶性结节区别的评分标准，当普通B超怀疑可能是恶性结节时，就需要做进一步检查。
进一步检查分为有创和无创两类：
1、无创检查：可以进一步做甲状腺超声造影，超声造影可以额外提供甲状腺结节的血流供应信息，可以对良恶性诊断提供进一步的证据；
2、甲状腺结节穿刺活检：穿刺活检通常分为两类办法，一类是细针穿刺的细胞学检查，一类是粗针穿刺的组织学检查。
通常通过B超、超声造影和活检这三步检查就可以在术前鉴别出甲状腺结节的良、恶性。