胃食管反流手术通常是微创手术，常指胃底折叠术，根据食管反流严重程度，可以分为180°折叠、270°折叠以及360°折叠。以上方法都是通过相同的手术入路，通常是在腹部开4个孔，由腹腔镜和其他手术器械逐步进入。在腹腔镜下充分游离胃底后，将胃底对食管进行折叠。

如果患者同时合并有食管裂孔疝，需术中同时进行修补。因为食管裂孔疝会加重胃食管反流症状，同样属于微创手术。通常手术需将应用补片，对发生食管裂孔疝的部位进行修补，以达到治疗目的。