脑干梗塞的最佳治疗方案，是进行溶栓或动脉取栓。脑干是生命中枢，可以将大脑皮层的信号传导至全身。脑干是既狭窄又重要的区域，如果出现脑干梗塞，后果可能较为严重，例如四肢瘫痪等，还可能影响上行网状激活系统，导致意识障碍。另外脑干是人的生命中枢，呼吸中枢、循环中枢都在脑干，如果脑干病变累及上述区域，可能会引发患者死亡。
脑干梗塞要在第一时间打通血管，主要通过溶栓和动脉取栓完成。溶栓需要在发病后4.5小时进行，明确诊断之后立刻进行治疗。如果是大血管血栓形成，错过溶栓治疗时间窗，还可以在发病16小时内进行动脉取栓治疗。这是目前两个唯一能够打通血管的治疗手段。一旦发现出现脑血管病的迹象，立刻到医院里进行检查和治疗。
