甲胎蛋白异质体是由蛋白结构不同的甲胎蛋白衍生而来，临床上主要包括三种，即甲胎蛋白异质体1、甲胎蛋白异质体2和甲胎蛋白异质体3，不同类型在临床上代表的疾病类型也不同。
一般一些慢性活动性肝炎的患者或者肝硬的患者，常会出现甲胎蛋白异质体1指标的明显升高，而甲胎蛋白异质体3指标的明显升高，常提示原发性肝癌疾病的存在。
而甲胎蛋白抑制体2指标的明显升高，常提示被监测者可能患有卵巢肿瘤或者是卵巢囊肿等疾病。还有些女性在妊娠初期，也可能会出现甲胎蛋白异质体2指标的轻度升高。
临床上可以通过甲胎蛋白异质体的不同类型，来评估被监测者患有何种疾病，然后根据不同的原因，采取个体化的治疗措施，使甲胎蛋白异质体的指标恢复到正常水平。
