类风湿关节炎属于一种自身免疫性疾病，体内免疫紊乱造成，而青霉素治疗体内细菌，用抗菌药很难治疗类风湿关节炎，因为药不对症，不应使用青霉素治疗类风湿关节炎。所以一旦确诊类风湿关节炎，应该由专业风湿科医生进行治疗，通常加用慢作用抗风湿药，比如可能加用甲氨蝶呤、来氟米特、艾拉莫德、羟氯喹、柳氮磺胺吡啶等药物，可能亦加用生物制剂甚至靶向药控制自身免疫紊乱。

自身免疫紊乱使用青霉素难以恢复，因为体内免疫紊乱已经不再由于某种细菌、链球菌、葡萄球菌等感染活动性炎症造成。但当类风湿关节炎合并活动性扁桃体炎或者明确大叶性肺炎情况下，需要使用青霉素或者其他抗生素进行感染控制，将感染控制后，抗生素仍需要停用。而类风湿关节炎治疗需要维持常规的慢作用抗风湿药，因为其属于慢性疾病，需要规律到风湿科医生长期随诊并进行治疗。