免疫系统的检查，主要包括采血的化验检查，以及超声检查、CT检查或者核磁等影像学检查。
通常主要怀疑到免疫系统疾病时，医生会给患者进行相应的免疫细胞学检查，如患者可能会查自身抗体谱，会查免疫球蛋白、补体。自身抗体谱主要包括抗核抗体、抗ENA抗体，也就是核可提取抗原的抗体。
此外，患者可能还会做相应的根据具体临床症状而判断相应疾病的检查，如果患者明确出现关节肿和疼，又出现在双手小关节，医生通常怀疑患者出现类风湿关节炎，会开具类风湿因子、CCP抗体等采血项目的检查。
如果患者明显出现光过敏，如双手遇冷变白、变紫等情况，医生可能会怀疑到系统性红斑狼疮、混合性结缔组织病等，会开具抗核抗体、ENA抗体等检查。
如果医生怀疑到IgG4相关疾病，或者肌炎、皮肌炎等疾病，医生除了会开具上述抗体检查，还应了解患者免疫系统其他器官的状态，如淋巴结检查，以及脾脏、肝脏的超声检查。
所以免疫系统的检查通常因人而异，根据相应怀疑到的疾病，患者会进行相应检查与排除。
