龟头瘙痒最常见于真菌引起的龟头炎或细菌引起的龟头炎，可以选择以下药物治疗：
1、3%的硼酸洗液：病人发生龟头瘙痒时，可以选用3%的硼酸洗液局部清洗，3%的硼酸洗液对各种真菌及细菌都有明显的治疗效果；
2、硝酸咪康唑乳膏：龟头发生瘙痒时，还可以局部涂抹达克宁(硝酸咪康唑乳膏)治疗，硝酸咪康唑乳膏对多种真菌感染有明显的治疗效果；
3、盐酸特比萘芬乳膏：龟头瘙痒还可以用丁克软膏(盐酸特比萘芬乳膏)治疗，盐酸特比萘芬乳膏对各种白色念珠菌引起的龟头炎有明显的治疗效果；
4、克霉唑软膏：龟头瘙痒还可以使用克霉唑软膏局部涂抹，克霉唑软膏局部涂抹后多数男性龟头瘙痒症状会明显好转。
由于龟头瘙痒常常在夫妻之间同时传染，所以在治疗期间不能同房，在治疗期间需要消毒内裤。在治疗期间不能饮酒，不能吃辛辣食物。龟头瘙痒还可以口服药物治疗，对合并细菌感染的龟头炎，可以口服红霉素肠溶胶囊治疗。
