孕酮低多数和黄体功能不足有关，在月经后半期会形成黄体，而黄体是产生雌激素和孕激素的，为以后怀孕做准备。如果黄体功能出现不足，产生的孕酮低，以后如果怀孕可能容易发生流产，这时就是黄体功能不足引起的，可能会发生流产或不容易怀孕。

另外，有些女性可能根本没有排卵，不排卵当然就不能够形成黄体，孕酮值在孕期后半期去测，可能会很低的状态。不容易来月经，只有把黄体激素补充上之后才能够来月经。

就是怀孕之后有的人测孕酮偏低，可能是原因也可能是结果，可能是胚胎自身有问题，如胚胎染色体有问题，或其他问题导致孕酮值偏低，或由于黄体功能不好，或其他疾病导致孕酮低，然后容易引起流产，胚胎就不能够继续妊娠下去。

如果是宫外孕可能也会表现为孕酮低，如果怀孕之后孕酮值按照纳摩尔每升的值来算，低于20nmol/l，一般就认为胚胎发育特别不好，或宫外孕的可能性，＞50nmol/l基本认为是胚胎发育比较好。如果在20-50nmol/l，就可能是前者或后者，要看胚胎走势。