肛周脓肿通过手术治疗，90%以上可达治愈。如果不手术，临时性用抗生素抗炎消肿治疗，也可能暂时得到缓解，但会留下隐患。当机体免疫力低下、疲劳或者在进食辛辣食品刺激情况下，会再次发作，影响工作、生活。要想痊愈只能通过手术治疗，所以肛周脓肿建议进行手术治疗。

手术治疗现在有以下两种：

1、切排掉脓腔形成自然肛瘘管道，等三个月以后再进行肛瘘切除；

2、肛周脓肿有内口，叫肛腺内口，如果在手术中把内口打开，清理掉以后可以达到一次性治愈目的。