肝区晚上疼痛可能与以下几点有关：

1、胃肠道相关问题：尤其是晚上12:00以后，肝区疼痛是由于胃里面没有食物，只剩下胃酸，胃酸这个时候有可能会侵蚀到胃表面一些溃疡区，比如胃糜烂或者十二指肠有糜烂的病人，这个时候会出现疼痛，这种空腹痛还是应该考虑胃肠道相关的胃溃疡，或者胃糜烂；

2、肝胆问题：因为晚餐通常是中国最丰盛的一顿，摄入的油腻饮食也最多，偶尔可能还会喝酒，这种情况也容易诱发胆囊结石，或者胆囊炎，导致肝区晚上疼痛；

3、结肠相关疾病：因为人体有结肠肝曲，如果出现肝区晚上疼痛，要考虑有无结肠息肉或者结肠炎等相关表现；

4、胰腺相关疾病：在右上腹有胰腺，有时胰腺肿瘤或者胰腺炎的发作，也会导致肝区晚上疼痛比较明显。

因此如果出现肝区晚上疼痛的情况，尤其是长期隐痛不舒服，还需要及时到医院做相关的检查，比如B超、上腹的CT、抽血等，明确这些脏器是否存在相关病变。