消化系统肿瘤标志物，包括的项目较多。临床上常见癌胚抗原，即CEA。该指标与消化系统肿瘤有关，如胃癌、肠癌、胰腺癌、胆道癌、肝癌的发生。但因为其特异性略差，可与其他肿瘤发生有一定关系，如乳腺癌、妇科肿瘤，如卵巢癌的发生，所以并不绝对。

除外，其他的消化系统肿瘤，多以糖类抗原为主，包括CA19-9，考虑与胰腺癌和大肠癌的发生有一定相关性。还包括CA72-4，考虑与胃癌发生有关，而CA-50、CA-242，也考虑与消化系统肿瘤相关。

血清学肿瘤标志物，在癌症诊断和筛查的过程中，起着至关重要的作用，但不能作为直接诊断肿瘤的依据。在临床上如果发现这些肿瘤标志物出现显著、异常升高，主要结合影像学的检查，如腹部彩超或者CT，结合胃镜、肠镜的检查，进一步判断消化系统中是否存在可疑、异常的病灶。一旦发现，需及早诊断，及早治疗，从而改变病人的预后，达到长期生存。