疱疹性咽峡炎和手足口病，孩子都可能会在嘴里出现疱疹或者皮疹，但是二者之间还是有一定的区别。具体分析如下：
1、病毒类型不同：疱疹性咽峡炎主要是由A组柯萨奇病毒感染所引起；而手足口病可能有多种肠道病毒，尤其像EV71这样的病毒感染，引起孩子出现手足口病，往往疾病会比较严重；
2、部分症状不同：疱疹性咽峡炎和手足口病的孩子可能往往都会有发热，但是皮疹可能有所区别。疱疹性咽峡炎的孩子，疱疹主要发生在咽部，可能让孩子张嘴往里面看，会看到孩子咽部出现有小的疱疹；而手足口病的孩子疱疹往往出现在口腔内，同时在手、足、臀部也会有皮疹出现，这些皮疹往往不疼不痒，也不会结痂，不会留疤，对孩子的影响并不大。所以，二者在表现上也不太一样。另外，重症手足口病的孩子往往会出现非常明显的神经系统异常，而且疾病进展特别快，有些孩子可能会出现死亡，对孩子影响很大。而疱疹性咽峡炎，总体而言大部分还是属于轻症的上呼吸道感染，一般可能发生特别严重并发症的机会相对较小。
二者都是病毒感染，所以在处理上大部分以对症治疗为主。
