乳酸菌和益生菌的区别是局部与整体的区别，即乳酸菌包括在益生菌内。乳酸菌是一种益生菌，益生菌是一大名词概念，顾名思义肠道里对人体有益的细菌，都叫益生菌，包括有双歧杆菌、乳酸菌、粪球菌等，这些能够在肠道里定植、繁殖、分解消化食物，使得食物分解成为能够被肠绒毛吸收、利用微小的微粒。所以益生菌是人体需要的。
在肠道菌群失调的情况下，就要补充益生菌来改变肠道的菌群结构，而竞争性地抑制有害菌生长，让有益菌能够建立起来、成长起来。现在有研究用大便提取物，在中医里叫金汁，然后回输给病人，当然可以采取灌肠的方式，治疗肠易激综合征、肠道菌群失调的病人，包括溃疡性结肠炎的病人，都有一定效果。
