男性有泌尿系统感染，建议使用头孢菌素类、喹诺酮类、大环内酯类的药物，这几类药在泌尿生殖道浓度高，作用效果好。
最常见的药物有头孢地尼、头孢克洛、罗红霉素、阿奇霉素、米诺环素，以及左氧氟沙星、环丙沙星、依诺沙星、莫西沙星。男性有泌尿系统感染时，需多饮水、多排尿，早期使用广谱抗菌素进行治疗。
如果是由于不洁性交引起，此时出现尿道口流脓，尿道内有刺痒等症状，应取分泌物找到引起其感染的病菌。如果为淋球菌感染，建议使用头孢曲松钠，大剂量青霉素静脉注射，通常3天即可达到临床治愈。
如果为非淋感染引起，此时可使用阿奇霉素、罗红霉素进行治疗，需要治疗10-14天。普通的细菌感染吃左氧氟沙星，即可缓解症状。
