幽门螺杆菌的检查方法分为侵入性和非侵入性，以非侵入性检查为主，包括C14或者C13呼气试验、血清HP抗体检测、粪便HP抗原检测。侵入性检查主要依靠胃镜检查时进行胃黏膜活检、胃黏膜组织快速尿素酶试验、胃黏膜组织切片染色、细菌培养、基因检测等。
除血清学检测外，其他方法检测前需停用质子泵抑制剂2周、铋剂和抗菌药物4周，根治后建议4-8周进行复查，使用快速尿素酶试验复查。14岁以下儿童不推荐常规检测幽门螺杆菌。非侵入性检查比较容易被人们接受，C13或者C14呼气试验准确率高达95%以上，因此，目前多采用C13或者C14呼气试验检测幽门螺杆菌。
