早上起床脖子一侧疼痛，其原因常见有以下几种：

1、枕头太高：睡眠过程中枕头枕得太高，导致颈椎处于不正常的位置，容易在侧卧位时，一侧肌肉由于枕头太高而始终处于持续紧张，或受牵拉的状态，肌肉便会处于疲劳的状态。早晨起床时，肌肉由于长时间的拉力增高，或疲劳，而出现反射性的痉挛，便会引起患者出现一侧颈部比较明显的疼痛；

2、睡眠姿势不当：部分患者不是正常的平卧，或侧卧，可能是脖子扭着，或歪着睡觉，会造成肌肉出现损伤，或伴有颈椎小关节的损伤，即关节囊受到不正常的拉力后，造成的损伤性病变。患者此时便会表现为一侧颈部的肌肉、关节、韧带疼痛，严重的还会伴有颈部僵硬、活动受限，通常需要几天时间，以及用药之后才能缓解。

因此，平常的睡姿或枕头高度，对颈部的保护较为关键，建议患者选择合适的枕头，或保持正常的睡姿，来避免出现不良情况。