割完包皮的后遗症一是短期有问题，二是长期有问题。短期刚做手术，患者肯定有疼痛、水肿，在一段时间后都会消失。但每个人有差异，疼痛和水肿在极少数人中可能持续很长时间，甚至半年到1年，有些人短期会出现出血。水肿、疼痛、出血基本都会消失，不会长期存在。
长期后遗症主要因素有两种，一种是手术前的选择，像有些病人勃起功能障碍，比如有凝血功能问题。这种病人做手术可能导致长期问题，比如勃起功能障碍会进一步加重。还有手术经验问题，有些医生操作手术较少，做完后会导致系带过短，引起经常性患者勃起疼痛，可能长期出现，但也可处理，需重新到医院再行手术。
